2026年05月15日
围绕HIV-1蛋白酶抑制剂研究的合作团队（从右逆时针）：Faez Iqbal Khan博士、硕士生谢雨昕、博士生邱丹文、Magdalini Matziari博士。
谢雨昕是西交利物浦大学生物科学与生物信息学系的硕士研究生，在Faez Iqbal Khan博士指导下开展研究。Khan博士主要从事计算生物学与基于结构的药物设计研究。在硕士阶段，谢雨昕参与了多项计算药物研发相关课题，并在团队合作中积累了科研经验。目前，她已参与完成三篇经同行评议的学术论文。
在一项以她为第一作者的研究中，谢雨昕与Magdalini Matziari博士及博士生邱丹文合作，围绕靶向HIV-1蛋白酶的膦酸假肽抑制剂开展分子动力学模拟及结合自由能分析。相关成果以《Phosphinate Pseudopeptide Enhances Binding Free Energy in HIV-1 Protease by Driving Flap Closure and Suppressing Global Flexibility》为题，被《Protein Science》期刊接收。该研究从原子层面探讨了抑制剂与蛋白结合的可能机制，并识别出若干具有进一步研究潜力的候选化合物。通过这一项目，她进一步理解了手性异构体对抑制活性的影响，也提升了对结合口袋细微构象变化的分析能力。
在另一项合作研究中，谢雨昕参与了来源于丝氨酸的膦酸肽类MMP-13抑制剂的设计与计算评估。相关论文《Novel Serine-Derived Phosphinic Peptides as Potent MMP-13 Inhibitors》发表于《Bioorganic Chemistry》。该研究结合分子对接、分子动力学模拟及ADMET性质预测，对候选化合物的抑制效果与成药相关性质进行了评估，为后续分子优化提供了参考。该项目也帮助她进一步认识到药代动力学与药效学因素在药物设计中的重要性，并积累了与合成化学团队合作的经验。
此外，谢雨昕还参与了由Hassan教授主导的一项多学科研究，探讨Aurora激酶B在盐酸胍诱导下的折叠稳定性变化。相关成果发表于《International Journal of Biological Macromolecules》。研究结合光谱实验与分子动力学模拟，分析了蛋白质展开过程及影响激酶稳定性的结构因素。参与该项目的过程中，她进一步了解了计算模拟如何与实验方法相互补充，也锻炼了在跨学科团队中开展研究的能力。
通过参与多项研究课题，谢雨昕逐步拓展了对计算生物学、结构生物学与药物设计等领域的理解，也在项目实践中提升了数据分析、问题拆解和团队协作能力。
除参与科研项目外，谢雨昕也积极参与课题组的日常交流与合作。目前，她还参与多篇合作论文的撰写工作，并协助开发了基于Python的自动化流程，用于结构特征提取与分子可视化分析，为课题组相关研究提供了支持。在Khan博士的指导下，她在开放、协作的科研环境中持续积累经验、提升能力。
内容：Faez Iqbal Khan博士
审核：John Moraros教授、Faez Iqbal Khan博士
2026年05月15日