西浦计算机科学与软件工程博士生发表论文,为诊断和治疗遗传疾病提供线索

2023年03月13日

我对染色体矫正相关的研究很感兴趣,因为它在核型构建、病理诊断和细胞遗传学图谱开发等各个领域有重要意义。

 

 

2023年3月2日,西交利物浦大学西浦创业家学院(太仓)的计算机科学与软件工程博士生宋思凡作为第一作者,撰写的一篇题为 “A Robust Framework of Chromosome Straighteningwith ViT-Patch GAN”的研究论文,由IEEE国际生物医学成像研讨会(IEEE ISBI)收录。

宋思凡利用深度学习模型开展生物医学图像处理与分析,使名为ViT-Patch GAN 的架构开发了一种染色体矫直的稳健框架。此框架有助于保留染色体中大部分的形状和条带模式细节,为遗传疾病的诊断准确性和治疗方法提供依据。“染色体矫正是一项具有挑战性的计算机视觉任务,有效的深度学习模型的开发可以促进计算机视觉和机器学习研究的发展。”宋思凡针对为何选择此科研项目进行研究的提问时解释道。

此篇论文由西浦人工智能与先进计算学院副院长苏炯龙博士指导完成。宋思凡提到,此次研究成果离不开苏炯龙博士提供的实验资源与指导。“研究过程中,我在确立染色体矫正方法时遇到了挑战。缺乏足够的测试集数据使开发有效的深度学习模型变得十分困难。为了克服这一挑战,苏炯龙博士协助我,通过使用一种自学习的运动变换生成器,得以让ViT-Patch GAN架构获取染色体运动的相关数据,为后期染色体矫直成为可能做铺垫。”宋思凡说道。

IEEE国际生物医学成像研讨会是由IEEE信号处理协会(SPS)和IEEE医药与生物学工程学会(EMBS)联合发起。此研讨会致力于对生物和生物成像方面的数学、算法和计算机在内的观测,推动不同领域的成像知识相互流通,促进生物医学成像的融合。

 

记者:徐浩伦

2023年03月13日

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